Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms