Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cfdp1O88271 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cfdp1O88271 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cfdp1O88271 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cfdp1O88271 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cfdp1O88271 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cfdp1O88271 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cfdp1O88271 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cfdp1O88271 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cfdp1O88271 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cfdp1O88271 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Cfdp1O88271 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cfdp1O88271 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cfdp1O88271 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cfdp1O88271 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cfdp1O88271 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cfdp1O88271 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cfdp1O88271 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Cfdp1O88271 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cfdp1O88271 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Cfdp1O88271 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cfdp1O88271 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cfdp1O88271 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cfdp1O88271 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cfdp1O88271 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cfdp1O88271 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cfdp1O88271 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cfdp1O88271 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cfdp1O88271 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cfdp1O88271 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cfdp1O88271 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cfdp1O88271 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cfdp1O88271 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cfdp1O88271 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cfdp1O88271 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cfdp1O88271 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cfdp1O88271 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cfdp1O88271 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cfdp1O88271 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cfdp1O88271 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cfdp1O88271 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cfdp1O88271 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cfdp1O88271 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cfdp1O88271 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cfdp1O88271 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cfdp1O88271 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cfdp1O88271 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms