Protein–RNA interactions for Protein: O75200

NPIPB7, Nuclear pore complex-interacting protein family member B7, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB7O75200 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 259 ms