Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN2BO60939 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN2BO60939 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN2BO60939 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN2BO60939 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN2BO60939 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN2BO60939 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN2BO60939 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN2BO60939 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN2BO60939 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN2BO60939 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN2BO60939 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN2BO60939 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms