Protein–RNA interactions for Protein: O60938

KERA, Keratocan, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KERAO60938 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KERAO60938 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KERAO60938 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KERAO60938 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KERAO60938 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KERAO60938 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KERAO60938 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KERAO60938 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KERAO60938 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KERAO60938 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KERAO60938 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KERAO60938 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KERAO60938 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KERAO60938 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KERAO60938 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KERAO60938 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KERAO60938 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KERAO60938 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KERAO60938 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KERAO60938 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KERAO60938 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KERAO60938 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KERAO60938 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KERAO60938 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KERAO60938 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KERAO60938 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KERAO60938 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KERAO60938 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KERAO60938 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KERAO60938 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KERAO60938 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KERAO60938 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KERAO60938 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KERAO60938 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KERAO60938 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KERAO60938 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KERAO60938 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KERAO60938 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KERAO60938 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KERAO60938 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KERAO60938 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KERAO60938 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KERAO60938 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KERAO60938 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KERAO60938 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
KERAO60938 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KERAO60938 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KERAO60938 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KERAO60938 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KERAO60938 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KERAO60938 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KERAO60938 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KERAO60938 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KERAO60938 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KERAO60938 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KERAO60938 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KERAO60938 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KERAO60938 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KERAO60938 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KERAO60938 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KERAO60938 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KERAO60938 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KERAO60938 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KERAO60938 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KERAO60938 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KERAO60938 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KERAO60938 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KERAO60938 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KERAO60938 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KERAO60938 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KERAO60938 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KERAO60938 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KERAO60938 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KERAO60938 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KERAO60938 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KERAO60938 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KERAO60938 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KERAO60938 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KERAO60938 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KERAO60938 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KERAO60938 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KERAO60938 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KERAO60938 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KERAO60938 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KERAO60938 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KERAO60938 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KERAO60938 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KERAO60938 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KERAO60938 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KERAO60938 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KERAO60938 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KERAO60938 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KERAO60938 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KERAO60938 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KERAO60938 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KERAO60938 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KERAO60938 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KERAO60938 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KERAO60938 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KERAO60938 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms