Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRAMEF4O60810 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms