Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC3O60481 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC3O60481 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC3O60481 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC3O60481 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZIC3O60481 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZIC3O60481 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZIC3O60481 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC3O60481 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC3O60481 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC3O60481 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC3O60481 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZIC3O60481 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZIC3O60481 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC3O60481 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC3O60481 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC3O60481 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC3O60481 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC3O60481 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC3O60481 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC3O60481 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC3O60481 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC3O60481 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC3O60481 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC3O60481 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC3O60481 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZIC3O60481 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC3O60481 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC3O60481 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC3O60481 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC3O60481 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC3O60481 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC3O60481 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC3O60481 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC3O60481 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC3O60481 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC3O60481 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC3O60481 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC3O60481 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC3O60481 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZIC3O60481 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC3O60481 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC3O60481 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC3O60481 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC3O60481 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC3O60481 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC3O60481 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC3O60481 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC3O60481 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZIC3O60481 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC3O60481 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC3O60481 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC3O60481 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC3O60481 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC3O60481 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC3O60481 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC3O60481 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC3O60481 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC3O60481 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC3O60481 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC3O60481 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC3O60481 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC3O60481 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC3O60481 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC3O60481 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC3O60481 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC3O60481 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC3O60481 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC3O60481 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms