Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCM3APO60318 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCM3APO60318 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCM3APO60318 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCM3APO60318 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCM3APO60318 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCM3APO60318 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MCM3APO60318 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MCM3APO60318 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCM3APO60318 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCM3APO60318 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCM3APO60318 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCM3APO60318 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCM3APO60318 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCM3APO60318 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCM3APO60318 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCM3APO60318 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCM3APO60318 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCM3APO60318 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCM3APO60318 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCM3APO60318 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCM3APO60318 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCM3APO60318 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCM3APO60318 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCM3APO60318 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCM3APO60318 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MCM3APO60318 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCM3APO60318 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCM3APO60318 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCM3APO60318 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MCM3APO60318 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCM3APO60318 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCM3APO60318 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCM3APO60318 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCM3APO60318 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCM3APO60318 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCM3APO60318 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCM3APO60318 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCM3APO60318 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCM3APO60318 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCM3APO60318 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCM3APO60318 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCM3APO60318 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCM3APO60318 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCM3APO60318 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCM3APO60318 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCM3APO60318 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCM3APO60318 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCM3APO60318 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCM3APO60318 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCM3APO60318 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCM3APO60318 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCM3APO60318 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCM3APO60318 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MCM3APO60318 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCM3APO60318 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCM3APO60318 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCM3APO60318 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms