Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RngttO55236 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RngttO55236 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RngttO55236 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RngttO55236 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RngttO55236 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RngttO55236 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RngttO55236 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RngttO55236 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RngttO55236 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RngttO55236 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RngttO55236 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RngttO55236 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RngttO55236 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RngttO55236 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RngttO55236 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RngttO55236 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RngttO55236 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RngttO55236 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RngttO55236 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RngttO55236 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RngttO55236 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RngttO55236 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RngttO55236 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RngttO55236 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RngttO55236 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RngttO55236 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RngttO55236 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RngttO55236 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RngttO55236 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RngttO55236 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RngttO55236 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RngttO55236 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RngttO55236 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RngttO55236 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RngttO55236 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RngttO55236 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RngttO55236 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RngttO55236 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RngttO55236 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RngttO55236 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RngttO55236 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RngttO55236 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RngttO55236 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RngttO55236 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RngttO55236 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RngttO55236 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RngttO55236 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RngttO55236 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RngttO55236 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RngttO55236 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RngttO55236 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RngttO55236 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RngttO55236 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RngttO55236 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RngttO55236 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RngttO55236 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RngttO55236 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RngttO55236 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RngttO55236 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RngttO55236 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RngttO55236 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RngttO55236 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RngttO55236 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RngttO55236 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RngttO55236 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RngttO55236 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RngttO55236 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RngttO55236 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RngttO55236 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RngttO55236 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RngttO55236 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RngttO55236 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RngttO55236 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RngttO55236 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RngttO55236 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RngttO55236 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RngttO55236 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RngttO55236 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RngttO55236 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RngttO55236 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RngttO55236 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RngttO55236 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RngttO55236 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RngttO55236 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RngttO55236 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RngttO55236 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RngttO55236 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RngttO55236 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RngttO55236 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RngttO55236 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RngttO55236 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RngttO55236 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RngttO55236 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RngttO55236 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RngttO55236 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RngttO55236 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RngttO55236 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RngttO55236 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RngttO55236 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms