Protein–RNA interactions for Protein: O55233

Cer1, Cerberus, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cer1O55233 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cer1O55233 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cer1O55233 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cer1O55233 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cer1O55233 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cer1O55233 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cer1O55233 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cer1O55233 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cer1O55233 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cer1O55233 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cer1O55233 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cer1O55233 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cer1O55233 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cer1O55233 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cer1O55233 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cer1O55233 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cer1O55233 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cer1O55233 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cer1O55233 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms