Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChadO55226 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChadO55226 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChadO55226 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ChadO55226 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChadO55226 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChadO55226 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChadO55226 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChadO55226 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChadO55226 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ChadO55226 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChadO55226 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChadO55226 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChadO55226 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChadO55226 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChadO55226 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChadO55226 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChadO55226 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChadO55226 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChadO55226 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChadO55226 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChadO55226 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChadO55226 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChadO55226 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChadO55226 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChadO55226 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChadO55226 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChadO55226 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChadO55226 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ChadO55226 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChadO55226 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ChadO55226 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChadO55226 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChadO55226 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChadO55226 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChadO55226 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChadO55226 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChadO55226 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChadO55226 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChadO55226 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ChadO55226 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ChadO55226 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChadO55226 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChadO55226 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChadO55226 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChadO55226 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChadO55226 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChadO55226 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChadO55226 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChadO55226 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChadO55226 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChadO55226 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChadO55226 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChadO55226 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChadO55226 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChadO55226 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChadO55226 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChadO55226 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChadO55226 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChadO55226 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChadO55226 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChadO55226 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChadO55226 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ChadO55226 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChadO55226 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChadO55226 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChadO55226 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChadO55226 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChadO55226 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChadO55226 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChadO55226 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChadO55226 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChadO55226 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChadO55226 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChadO55226 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChadO55226 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChadO55226 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChadO55226 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChadO55226 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChadO55226 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChadO55226 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChadO55226 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChadO55226 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChadO55226 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChadO55226 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChadO55226 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ChadO55226 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChadO55226 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ChadO55226 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ChadO55226 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChadO55226 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ChadO55226 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChadO55226 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChadO55226 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChadO55226 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChadO55226 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChadO55226 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChadO55226 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChadO55226 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChadO55226 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms