Protein–RNA interactions for Protein: O55106

Strn, Striatin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StrnO55106 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
StrnO55106 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
StrnO55106 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
StrnO55106 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
StrnO55106 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
StrnO55106 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
StrnO55106 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
StrnO55106 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
StrnO55106 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
StrnO55106 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
StrnO55106 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
StrnO55106 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
StrnO55106 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
StrnO55106 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
StrnO55106 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
StrnO55106 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
StrnO55106 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
StrnO55106 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
StrnO55106 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
StrnO55106 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
StrnO55106 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
StrnO55106 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
StrnO55106 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
StrnO55106 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
StrnO55106 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
StrnO55106 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
StrnO55106 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
StrnO55106 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
StrnO55106 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
StrnO55106 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
StrnO55106 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
StrnO55106 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
StrnO55106 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
StrnO55106 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
StrnO55106 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
StrnO55106 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
StrnO55106 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
StrnO55106 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
StrnO55106 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
StrnO55106 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
StrnO55106 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
StrnO55106 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
StrnO55106 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
StrnO55106 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
StrnO55106 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
StrnO55106 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
StrnO55106 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
StrnO55106 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
StrnO55106 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
StrnO55106 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
StrnO55106 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
StrnO55106 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
StrnO55106 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
StrnO55106 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
StrnO55106 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
StrnO55106 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
StrnO55106 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
StrnO55106 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
StrnO55106 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
StrnO55106 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
StrnO55106 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
StrnO55106 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
StrnO55106 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
StrnO55106 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
StrnO55106 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
StrnO55106 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
StrnO55106 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
StrnO55106 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
StrnO55106 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
StrnO55106 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
StrnO55106 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
StrnO55106 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
StrnO55106 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
StrnO55106 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
StrnO55106 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
StrnO55106 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
StrnO55106 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
StrnO55106 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
StrnO55106 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
StrnO55106 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
StrnO55106 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
StrnO55106 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
StrnO55106 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
StrnO55106 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
StrnO55106 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
StrnO55106 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
StrnO55106 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
StrnO55106 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
StrnO55106 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
StrnO55106 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
StrnO55106 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
StrnO55106 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
StrnO55106 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
StrnO55106 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
StrnO55106 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
StrnO55106 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
StrnO55106 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
StrnO55106 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
StrnO55106 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
StrnO55106 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms