Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cldn5O54942 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cldn5O54942 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn5O54942 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn5O54942 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn5O54942 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn5O54942 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn5O54942 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn5O54942 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn5O54942 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn5O54942 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn5O54942 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn5O54942 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn5O54942 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn5O54942 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn5O54942 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn5O54942 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn5O54942 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn5O54942 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118 ms