Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChkaO54804 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChkaO54804 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChkaO54804 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChkaO54804 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChkaO54804 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ChkaO54804 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChkaO54804 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChkaO54804 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChkaO54804 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ChkaO54804 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.1 ms