Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxO54751 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxO54751 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxO54751 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxO54751 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxO54751 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxO54751 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxO54751 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxO54751 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxO54751 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxO54751 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxO54751 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxO54751 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxO54751 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxO54751 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxO54751 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxO54751 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxO54751 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxO54751 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxO54751 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxO54751 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxO54751 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxO54751 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxO54751 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxO54751 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxO54751 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxO54751 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxO54751 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CrxO54751 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CrxO54751 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrxO54751 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrxO54751 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrxO54751 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrxO54751 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrxO54751 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrxO54751 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrxO54751 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrxO54751 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrxO54751 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxO54751 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxO54751 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxO54751 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxO54751 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxO54751 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxO54751 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxO54751 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxO54751 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxO54751 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxO54751 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxO54751 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxO54751 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxO54751 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxO54751 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxO54751 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxO54751 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxO54751 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxO54751 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxO54751 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxO54751 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxO54751 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxO54751 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxO54751 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxO54751 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxO54751 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxO54751 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxO54751 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxO54751 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxO54751 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxO54751 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxO54751 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxO54751 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxO54751 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxO54751 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxO54751 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxO54751 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxO54751 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxO54751 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxO54751 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxO54751 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxO54751 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxO54751 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxO54751 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxO54751 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxO54751 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxO54751 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxO54751 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxO54751 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxO54751 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxO54751 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CrxO54751 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CrxO54751 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CrxO54751 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CrxO54751 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CrxO54751 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CrxO54751 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CrxO54751 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CrxO54751 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CrxO54751 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CrxO54751 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CrxO54751 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms