Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL13O43927 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CXCL13O43927 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CXCL13O43927 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL13O43927 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL13O43927 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL13O43927 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL13O43927 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL13O43927 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL13O43927 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL13O43927 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL13O43927 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL13O43927 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL13O43927 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL13O43927 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL13O43927 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL13O43927 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL13O43927 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL13O43927 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL13O43927 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL13O43927 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL13O43927 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL13O43927 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL13O43927 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL13O43927 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL13O43927 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL13O43927 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms