Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASA4O43374 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASA4O43374 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASA4O43374 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASA4O43374 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASA4O43374 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASA4O43374 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASA4O43374 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASA4O43374 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASA4O43374 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RASA4O43374 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASA4O43374 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RASA4O43374 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASA4O43374 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASA4O43374 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASA4O43374 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASA4O43374 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASA4O43374 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RASA4O43374 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RASA4O43374 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RASA4O43374 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RASA4O43374 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RASA4O43374 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RASA4O43374 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RASA4O43374 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASA4O43374 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASA4O43374 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RASA4O43374 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASA4O43374 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASA4O43374 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RASA4O43374 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASA4O43374 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASA4O43374 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASA4O43374 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASA4O43374 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASA4O43374 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASA4O43374 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASA4O43374 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASA4O43374 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASA4O43374 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASA4O43374 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASA4O43374 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASA4O43374 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASA4O43374 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASA4O43374 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASA4O43374 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASA4O43374 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASA4O43374 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASA4O43374 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASA4O43374 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASA4O43374 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RASA4O43374 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASA4O43374 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASA4O43374 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASA4O43374 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASA4O43374 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASA4O43374 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RASA4O43374 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASA4O43374 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASA4O43374 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RASA4O43374 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASA4O43374 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASA4O43374 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASA4O43374 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASA4O43374 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASA4O43374 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASA4O43374 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASA4O43374 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASA4O43374 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASA4O43374 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RASA4O43374 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASA4O43374 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASA4O43374 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASA4O43374 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASA4O43374 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASA4O43374 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASA4O43374 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASA4O43374 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASA4O43374 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASA4O43374 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASA4O43374 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASA4O43374 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASA4O43374 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASA4O43374 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASA4O43374 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASA4O43374 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASA4O43374 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASA4O43374 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RASA4O43374 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RASA4O43374 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RASA4O43374 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RASA4O43374 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RASA4O43374 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RASA4O43374 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASA4O43374 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASA4O43374 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RASA4O43374 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASA4O43374 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASA4O43374 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASA4O43374 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms