Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCP110O43303 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCP110O43303 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCP110O43303 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCP110O43303 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCP110O43303 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCP110O43303 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCP110O43303 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCP110O43303 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCP110O43303 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCP110O43303 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCP110O43303 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCP110O43303 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCP110O43303 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCP110O43303 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCP110O43303 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCP110O43303 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCP110O43303 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCP110O43303 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCP110O43303 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCP110O43303 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCP110O43303 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCP110O43303 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCP110O43303 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCP110O43303 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCP110O43303 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCP110O43303 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCP110O43303 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCP110O43303 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCP110O43303 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCP110O43303 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCP110O43303 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCP110O43303 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCP110O43303 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCP110O43303 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCP110O43303 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCP110O43303 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCP110O43303 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCP110O43303 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCP110O43303 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCP110O43303 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCP110O43303 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCP110O43303 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCP110O43303 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCP110O43303 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCP110O43303 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCP110O43303 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCP110O43303 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCP110O43303 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCP110O43303 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCP110O43303 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCP110O43303 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCP110O43303 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCP110O43303 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCP110O43303 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCP110O43303 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCP110O43303 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCP110O43303 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCP110O43303 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCP110O43303 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCP110O43303 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCP110O43303 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCP110O43303 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCP110O43303 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCP110O43303 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCP110O43303 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCP110O43303 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCP110O43303 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCP110O43303 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCP110O43303 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCP110O43303 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCP110O43303 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCP110O43303 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCP110O43303 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCP110O43303 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCP110O43303 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCP110O43303 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCP110O43303 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCP110O43303 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCP110O43303 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCP110O43303 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCP110O43303 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCP110O43303 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCP110O43303 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCP110O43303 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCP110O43303 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCP110O43303 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCP110O43303 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCP110O43303 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCP110O43303 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCP110O43303 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCP110O43303 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCP110O43303 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCP110O43303 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCP110O43303 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCP110O43303 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCP110O43303 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCP110O43303 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCP110O43303 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCP110O43303 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms