Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC7A4O43246 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms