Protein–RNA interactions for Protein: O35716

Socs1, Suppressor of cytokine signaling 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs1O35716 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Socs1O35716 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Socs1O35716 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Socs1O35716 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Socs1O35716 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Socs1O35716 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Socs1O35716 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Socs1O35716 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Socs1O35716 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Socs1O35716 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Socs1O35716 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Socs1O35716 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Socs1O35716 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Socs1O35716 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Socs1O35716 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Socs1O35716 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Socs1O35716 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Socs1O35716 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Socs1O35716 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Socs1O35716 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Socs1O35716 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Socs1O35716 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Socs1O35716 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Socs1O35716 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Socs1O35716 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Socs1O35716 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Socs1O35716 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Socs1O35716 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Socs1O35716 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Socs1O35716 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Socs1O35716 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Socs1O35716 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Socs1O35716 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Socs1O35716 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Socs1O35716 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Socs1O35716 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Socs1O35716 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Socs1O35716 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms