Protein–RNA interactions for Protein: O35643

Ap1b1, AP-1 complex subunit beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1b1O35643 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap1b1O35643 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap1b1O35643 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ap1b1O35643 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ap1b1O35643 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ap1b1O35643 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ap1b1O35643 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ap1b1O35643 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ap1b1O35643 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ap1b1O35643 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap1b1O35643 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap1b1O35643 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap1b1O35643 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap1b1O35643 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap1b1O35643 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap1b1O35643 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap1b1O35643 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap1b1O35643 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap1b1O35643 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap1b1O35643 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap1b1O35643 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap1b1O35643 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap1b1O35643 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap1b1O35643 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap1b1O35643 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms