Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TnxbO35452 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TnxbO35452 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnxbO35452 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnxbO35452 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnxbO35452 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnxbO35452 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnxbO35452 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnxbO35452 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TnxbO35452 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TnxbO35452 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TnxbO35452 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms