Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kpna6O35345 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kpna6O35345 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kpna6O35345 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kpna6O35345 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kpna6O35345 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kpna6O35345 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kpna6O35345 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kpna6O35345 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kpna6O35345 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kpna6O35345 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kpna6O35345 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kpna6O35345 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms