Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2f3O35261 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
E2f3O35261 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2f3O35261 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
E2f3O35261 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2f3O35261 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2f3O35261 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2f3O35261 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms