Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bhlhe40O35185 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms