Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kif3cO35066 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kif3cO35066 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kif3cO35066 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kif3cO35066 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kif3cO35066 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kif3cO35066 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kif3cO35066 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kif3cO35066 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Kif3cO35066 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kif3cO35066 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kif3cO35066 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kif3cO35066 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kif3cO35066 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kif3cO35066 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms