Protein–RNA interactions for Protein: O15379

HDAC3, Histone deacetylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3O15379 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC3O15379 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms