Protein–RNA interactions for Protein: O15075

DCLK1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK1O15075 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLK1O15075 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms