Protein–RNA interactions for Protein: O14994

SYN3, Synapsin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3O14994 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYN3O14994 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYN3O14994 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYN3O14994 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYN3O14994 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYN3O14994 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYN3O14994 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYN3O14994 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYN3O14994 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYN3O14994 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYN3O14994 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYN3O14994 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYN3O14994 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYN3O14994 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SYN3O14994 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYN3O14994 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SYN3O14994 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYN3O14994 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYN3O14994 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYN3O14994 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYN3O14994 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYN3O14994 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYN3O14994 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYN3O14994 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYN3O14994 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYN3O14994 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYN3O14994 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYN3O14994 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYN3O14994 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYN3O14994 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYN3O14994 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYN3O14994 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYN3O14994 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYN3O14994 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYN3O14994 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SYN3O14994 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYN3O14994 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYN3O14994 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYN3O14994 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYN3O14994 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYN3O14994 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYN3O14994 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYN3O14994 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYN3O14994 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYN3O14994 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SYN3O14994 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYN3O14994 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYN3O14994 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYN3O14994 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYN3O14994 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYN3O14994 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYN3O14994 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYN3O14994 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYN3O14994 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYN3O14994 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYN3O14994 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYN3O14994 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYN3O14994 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYN3O14994 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYN3O14994 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYN3O14994 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SYN3O14994 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYN3O14994 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYN3O14994 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYN3O14994 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYN3O14994 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYN3O14994 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYN3O14994 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYN3O14994 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYN3O14994 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYN3O14994 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYN3O14994 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYN3O14994 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SYN3O14994 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SYN3O14994 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYN3O14994 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYN3O14994 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYN3O14994 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYN3O14994 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYN3O14994 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYN3O14994 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYN3O14994 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYN3O14994 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYN3O14994 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYN3O14994 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYN3O14994 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SYN3O14994 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYN3O14994 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYN3O14994 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYN3O14994 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYN3O14994 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYN3O14994 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYN3O14994 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYN3O14994 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SYN3O14994 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYN3O14994 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYN3O14994 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYN3O14994 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYN3O14994 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYN3O14994 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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