Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac1O09106 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac1O09106 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac1O09106 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac1O09106 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac1O09106 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac1O09106 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac1O09106 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac1O09106 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac1O09106 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac1O09106 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac1O09106 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac1O09106 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac1O09106 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac1O09106 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac1O09106 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac1O09106 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac1O09106 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac1O09106 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hdac1O09106 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hdac1O09106 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdac1O09106 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms