Protein–RNA interactions for Protein: O08967

Cyth3, Cytohesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth3O08967 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyth3O08967 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyth3O08967 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyth3O08967 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyth3O08967 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyth3O08967 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyth3O08967 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyth3O08967 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyth3O08967 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyth3O08967 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyth3O08967 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyth3O08967 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyth3O08967 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyth3O08967 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyth3O08967 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyth3O08967 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyth3O08967 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyth3O08967 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyth3O08967 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyth3O08967 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyth3O08967 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyth3O08967 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyth3O08967 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyth3O08967 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyth3O08967 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyth3O08967 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyth3O08967 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyth3O08967 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyth3O08967 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyth3O08967 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyth3O08967 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyth3O08967 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms