Protein–RNA interactions for Protein: O08917

Flot1, Flotillin-1, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flot1O08917 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Flot1O08917 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Flot1O08917 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Flot1O08917 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Flot1O08917 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Flot1O08917 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Flot1O08917 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Flot1O08917 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Flot1O08917 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Flot1O08917 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Flot1O08917 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Flot1O08917 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Flot1O08917 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Flot1O08917 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Flot1O08917 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Flot1O08917 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Flot1O08917 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Flot1O08917 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Flot1O08917 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Flot1O08917 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Flot1O08917 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Flot1O08917 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Flot1O08917 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Flot1O08917 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Flot1O08917 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Flot1O08917 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Flot1O08917 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Flot1O08917 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Flot1O08917 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Flot1O08917 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Flot1O08917 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Flot1O08917 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Flot1O08917 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Flot1O08917 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Flot1O08917 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Flot1O08917 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Flot1O08917 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
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