Protein–RNA interactions for Protein: O00399

DCTN6, Dynactin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN6O00399 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCTN6O00399 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCTN6O00399 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCTN6O00399 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCTN6O00399 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCTN6O00399 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCTN6O00399 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCTN6O00399 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCTN6O00399 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCTN6O00399 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCTN6O00399 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCTN6O00399 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCTN6O00399 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DCTN6O00399 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DCTN6O00399 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms