Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21976J3QNN2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21976J3QNN2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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