Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Ccdc180J3QNE4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Ccdc180J3QNE4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Ccdc180J3QNE4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
Ccdc180J3QNE4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Ccdc180J3QNE4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Ccdc180J3QNE4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Ccdc180J3QNE4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Ccdc180J3QNE4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Ccdc180J3QNE4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Ccdc180J3QNE4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Ccdc180J3QNE4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
Ccdc180J3QNE4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
Ccdc180J3QNE4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Ccdc180J3QNE4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Ccdc180J3QNE4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Ccdc180J3QNE4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Ccdc180J3QNE4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Ccdc180J3QNE4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Ccdc180J3QNE4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Ccdc180J3QNE4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Ccdc180J3QNE4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Ccdc180J3QNE4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Ccdc180J3QNE4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
Ccdc180J3QNE4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Ccdc180J3QNE4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC39.63■■■■□ 3.93
Ccdc180J3QNE4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Ccdc180J3QNE4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Ccdc180J3QNE4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Ccdc180J3QNE4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Ccdc180J3QNE4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
Ccdc180J3QNE4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Ccdc180J3QNE4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Ccdc180J3QNE4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Ccdc180J3QNE4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
Ccdc180J3QNE4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Ccdc180J3QNE4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Ccdc180J3QNE4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Ccdc180J3QNE4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Ccdc180J3QNE4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
Ccdc180J3QNE4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Ccdc180J3QNE4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Ccdc180J3QNE4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
Ccdc180J3QNE4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
Ccdc180J3QNE4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Ccdc180J3QNE4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Ccdc180J3QNE4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Ccdc180J3QNE4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC39.57■■■■□ 3.93
Ccdc180J3QNE4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC39.57■■■■□ 3.92
Ccdc180J3QNE4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
Ccdc180J3QNE4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
Ccdc180J3QNE4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Ccdc180J3QNE4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Ccdc180J3QNE4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Ccdc180J3QNE4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Ccdc180J3QNE4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
Ccdc180J3QNE4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Ccdc180J3QNE4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Ccdc180J3QNE4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Ccdc180J3QNE4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Ccdc180J3QNE4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Ccdc180J3QNE4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Ccdc180J3QNE4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Ccdc180J3QNE4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
Ccdc180J3QNE4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Ccdc180J3QNE4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Ccdc180J3QNE4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Ccdc180J3QNE4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
Ccdc180J3QNE4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Ccdc180J3QNE4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
Ccdc180J3QNE4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.91
Ccdc180J3QNE4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC39.51■■■■□ 3.91
Ccdc180J3QNE4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Ccdc180J3QNE4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Ccdc180J3QNE4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Ccdc180J3QNE4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Ccdc180J3QNE4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Ccdc180J3QNE4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Ccdc180J3QNE4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Ccdc180J3QNE4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Ccdc180J3QNE4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Ccdc180J3QNE4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Ccdc180J3QNE4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
Ccdc180J3QNE4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Ccdc180J3QNE4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Ccdc180J3QNE4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Ccdc180J3QNE4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Ccdc180J3QNE4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Ccdc180J3QNE4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Ccdc180J3QNE4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
Ccdc180J3QNE4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Ccdc180J3QNE4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Ccdc180J3QNE4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Ccdc180J3QNE4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Ccdc180J3QNE4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Ccdc180J3QNE4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Ccdc180J3QNE4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Ccdc180J3QNE4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC39.44■■■■□ 3.9
Ccdc180J3QNE4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms