Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU2

Gm21820, Predicted gene, 21820, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21820J3KMU2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm21820J3KMU2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm21820J3KMU2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm21820J3KMU2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm21820J3KMU2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21820J3KMU2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21820J3KMU2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21820J3KMU2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21820J3KMU2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21820J3KMU2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21820J3KMU2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21820J3KMU2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21820J3KMU2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21820J3KMU2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21820J3KMU2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm21820J3KMU2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm21820J3KMU2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm21820J3KMU2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm21820J3KMU2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm21820J3KMU2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm21820J3KMU2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm21820J3KMU2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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