Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pabpc4lG5E8X2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms