Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp17lcG5E8I7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp17lcG5E8I7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp17lcG5E8I7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp17lcG5E8I7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp17lcG5E8I7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp17lcG5E8I7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp17lcG5E8I7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp17lcG5E8I7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms