Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms