Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp9yF8VPU6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms