Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms