Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp17lbE9Q9U0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp17lbE9Q9U0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp17lbE9Q9U0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp17lbE9Q9U0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp17lbE9Q9U0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp17lbE9Q9U0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp17lbE9Q9U0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp17lbE9Q9U0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp17lbE9Q9U0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp17lbE9Q9U0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp17lbE9Q9U0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp17lbE9Q9U0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp17lbE9Q9U0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp17lbE9Q9U0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp17lbE9Q9U0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp17lbE9Q9U0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp17lbE9Q9U0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp17lbE9Q9U0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp17lbE9Q9U0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp17lbE9Q9U0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp17lbE9Q9U0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp17lbE9Q9U0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp17lbE9Q9U0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp17lbE9Q9U0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp17lbE9Q9U0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp17lbE9Q9U0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp17lbE9Q9U0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp17lbE9Q9U0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp17lbE9Q9U0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp17lbE9Q9U0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp17lbE9Q9U0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp17lbE9Q9U0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp17lbE9Q9U0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp17lbE9Q9U0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp17lbE9Q9U0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp17lbE9Q9U0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp17lbE9Q9U0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp17lbE9Q9U0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp17lbE9Q9U0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp17lbE9Q9U0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp17lbE9Q9U0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp17lbE9Q9U0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp17lbE9Q9U0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp17lbE9Q9U0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp17lbE9Q9U0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp17lbE9Q9U0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp17lbE9Q9U0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp17lbE9Q9U0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp17lbE9Q9U0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp17lbE9Q9U0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp17lbE9Q9U0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp17lbE9Q9U0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp17lbE9Q9U0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp17lbE9Q9U0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp17lbE9Q9U0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp17lbE9Q9U0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp17lbE9Q9U0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp17lbE9Q9U0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp17lbE9Q9U0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp17lbE9Q9U0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp17lbE9Q9U0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp17lbE9Q9U0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp17lbE9Q9U0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp17lbE9Q9U0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp17lbE9Q9U0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp17lbE9Q9U0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp17lbE9Q9U0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp17lbE9Q9U0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms