Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1iE9Q7P2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1iE9Q7P2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1iE9Q7P2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1iE9Q7P2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1iE9Q7P2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1iE9Q7P2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1iE9Q7P2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1iE9Q7P2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1iE9Q7P2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1iE9Q7P2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1iE9Q7P2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1iE9Q7P2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1iE9Q7P2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1iE9Q7P2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1iE9Q7P2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1iE9Q7P2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna1iE9Q7P2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna1iE9Q7P2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna1iE9Q7P2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna1iE9Q7P2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna1iE9Q7P2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cacna1iE9Q7P2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cacna1iE9Q7P2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cacna1iE9Q7P2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cacna1iE9Q7P2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1iE9Q7P2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1iE9Q7P2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms