Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4G9

Gm21293, Predicted gene, 21293, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21293E9Q4G9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm21293E9Q4G9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm21293E9Q4G9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21293E9Q4G9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm21293E9Q4G9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21293E9Q4G9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21293E9Q4G9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21293E9Q4G9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21293E9Q4G9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21293E9Q4G9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21293E9Q4G9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21293E9Q4G9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21293E9Q4G9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21293E9Q4G9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21293E9Q4G9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21293E9Q4G9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21293E9Q4G9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21293E9Q4G9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21293E9Q4G9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21293E9Q4G9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21293E9Q4G9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21293E9Q4G9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21293E9Q4G9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21293E9Q4G9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21293E9Q4G9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21293E9Q4G9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21293E9Q4G9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21293E9Q4G9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.5 ms