Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aldh3b2E9Q3E1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms