Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrp3E9Q1T6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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