Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Trappc8E9PWG2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Trappc8E9PWG2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Trappc8E9PWG2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Trappc8E9PWG2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Trappc8E9PWG2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Trappc8E9PWG2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Trappc8E9PWG2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Trappc8E9PWG2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Trappc8E9PWG2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Trappc8E9PWG2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Trappc8E9PWG2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Trappc8E9PWG2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Trappc8E9PWG2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Trappc8E9PWG2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Trappc8E9PWG2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Trappc8E9PWG2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Trappc8E9PWG2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Trappc8E9PWG2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Trappc8E9PWG2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Trappc8E9PWG2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Trappc8E9PWG2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Trappc8E9PWG2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Trappc8E9PWG2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Trappc8E9PWG2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Trappc8E9PWG2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Trappc8E9PWG2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Trappc8E9PWG2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Trappc8E9PWG2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Trappc8E9PWG2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms