Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
E9PCH4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
E9PCH4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
E9PCH4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
E9PCH4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
E9PCH4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
E9PCH4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
E9PCH4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
E9PCH4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
E9PCH4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
E9PCH4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
E9PCH4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
E9PCH4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
E9PCH4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
E9PCH4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
E9PCH4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
E9PCH4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC34.73■■■■□ 3.15
E9PCH4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
E9PCH4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
E9PCH4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
E9PCH4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
E9PCH4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
E9PCH4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
E9PCH4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
E9PCH4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
E9PCH4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
E9PCH4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
E9PCH4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
E9PCH4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
E9PCH4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
E9PCH4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
E9PCH4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
E9PCH4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
E9PCH4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
E9PCH4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
E9PCH4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC34.71■■■■□ 3.15
E9PCH4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
E9PCH4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
E9PCH4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
E9PCH4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
E9PCH4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
E9PCH4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
E9PCH4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
E9PCH4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
E9PCH4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
E9PCH4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
E9PCH4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
E9PCH4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
E9PCH4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
E9PCH4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
E9PCH4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
E9PCH4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
E9PCH4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
E9PCH4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
E9PCH4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
E9PCH4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
E9PCH4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
E9PCH4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
E9PCH4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
E9PCH4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
E9PCH4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
E9PCH4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
E9PCH4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
E9PCH4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
E9PCH4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
E9PCH4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
E9PCH4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
E9PCH4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
E9PCH4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
E9PCH4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
E9PCH4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
E9PCH4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
E9PCH4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
E9PCH4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
E9PCH4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
E9PCH4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
E9PCH4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
E9PCH4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
E9PCH4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
E9PCH4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
E9PCH4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
E9PCH4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
E9PCH4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
E9PCH4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
E9PCH4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
E9PCH4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
E9PCH4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
E9PCH4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
E9PCH4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
E9PCH4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
E9PCH4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
E9PCH4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
E9PCH4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
E9PCH4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
E9PCH4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
E9PCH4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
E9PCH4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC34.59■■■■□ 3.13
E9PCH4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
E9PCH4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
E9PCH4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms