Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPK3BL2E5RIL1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPK3BL2E5RIL1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPK3BL2E5RIL1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPK3BL2E5RIL1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPK3BL2E5RIL1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPK3BL2E5RIL1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPK3BL2E5RIL1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPK3BL2E5RIL1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPK3BL2E5RIL1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPK3BL2E5RIL1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPK3BL2E5RIL1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPK3BL2E5RIL1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPK3BL2E5RIL1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UPK3BL2E5RIL1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPK3BL2E5RIL1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPK3BL2E5RIL1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPK3BL2E5RIL1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPK3BL2E5RIL1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPK3BL2E5RIL1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPK3BL2E5RIL1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPK3BL2E5RIL1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPK3BL2E5RIL1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPK3BL2E5RIL1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPK3BL2E5RIL1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPK3BL2E5RIL1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPK3BL2E5RIL1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UPK3BL2E5RIL1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UPK3BL2E5RIL1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPK3BL2E5RIL1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms