Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ5

Tmed7, Transmembrane p24-trafficking protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed7D3YZZ5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed7D3YZZ5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed7D3YZZ5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms